До 1924 г. приходы на территории современной Новосибирской области (кроме части Чистоозерного, Купинского, Татарского и Усть-Таркского районов) входили в Томскую епархию. В феврале 1922 г. было учреждено Новониколаевское викариатство Томской епархии.
Самостоятельная Новониколаевская и Барнаульская епархия учреждена в 1924 г., в том же году переименована в Новосибирскую и Барнаульскую. С 1994 г. – Новосибирская и Томская, с 1995 г. – Новосибирская и Бердская.

Решением Священного Синода Русской Православной Церкви от 27-28 декабря 2011 года (журнал № 175) из состава Новосибирской епархии выделены Искитимская, Карасукская и Каинская епархии. Новосибирская епархия включена в Новосибирскую Митрополию.
Главой Новосибирской Митрополии и Управляющим Новосибирской Епархией является Митрополит Новосибирский и Бердский Никодим.
Новосибирская Епархия включает в себя три благочиннических округа: Новосибирский городской, Новосибирский сельский и Колыванский.
Кафедральные соборы Новосибирской Епархии: Вознесенский собор г. Новосибирска и Преображенский собор г. Бердска.

В Новосибирской Епархии:

Александро-Невский собор г. Новосибирска
Адрес, телефон: г. Новосибирск, ул. Советская, 1а
Приход во имя св. страстотерпца царя Николая Новосибирская епархия Русской Православной Церкви
Адрес, телефон: 630039, Новосибирская область, город Новосибирск, ул. Никитина, 105/1, тел. +7 923 175 7948
Вознесенский кафедральный собор г. Новосибирска
Адрес, телефон: Россия, Новосибирская область, г. Новосибирск, ул. Советская, 91